Grzechy Kościoła to książka podejmująca trudne dla polskich katolików tematy, takie jak: ludyczna odmiana katolicyzmu, mieszanie się instytucji Kościoła do polityki, ruchy wewnątrz Kościoła, Radio Maryja, brak tolerancji dla innych wyznań, bogacenie się kleru, pustoszenie kościołów, współpraca z bezpieką i inne. Autor, Tomasz Terlikowski, doktor filozofii, wyrazisty katolicki felietonista, pokazuje zarówno nadużycia, jak i sytuacje, w których Kościół zareagował właściwie.
Omawiając poczynania Ojca Dyrektora, podaje przykłady zza oceanu, z których jasno wynika, że najsłynniejszy polski redemptorysta mógłby się jeszcze wiele nauczyć. Czasami to po prostu kwestia podjęcia decyzji, czy ,,szklanka jest do połowy pełna, czy do połowy pusta".
Mimo że książka porusza bardzo kontrowersyjne tematy, w sposobie ich ujęcia nie ma nic z taniej sensacji, przeciwnie - autor liczy na rozwagę i mądrość czytelnika.
