Jednostki powinny opracować, wdrożyć, oceniać i doskonalić procedury kontroli w środowisku informatycznym. Ponadto na jednostki stosujące system informatyczny rachunkowości ustawodawca nałożył obowiązek zapewnienia bezpieczeństwa zasobów informatycznych, a w szczególności skutecznej ochrony zapisów księgowych i dokumentacji przed: o ich nieuprawnioną i niekontrolowaną modyfikacją lub uszkodzeniem, o wprowadzeniem, usunięciem lub ich zniszczeniem, o nieupoważnionym rozpowszechnianiem.
W Poradniku wskazano główne zasady przeprowadzenia procesu samooceny ustanowionych zasad i procedur kontroli zarządczej dotyczących systemu rachunkowości w środowisku informatycznym. Omówiono aktualne wymogi, które są zawarte w regulacjach prawnych i standardach, jak również wskazano rozwiązania praktyczne w zakresie organizacji kontroli zarządczej w środowisku informatycznym rachunkowości w jednostkach sektora finansów publicznych.
Z Poradnika można dowiedzieć się, jakie obowiązują zasady i procedury kontroli: o ochrony zasobów informatycznych rachunkowości, o dokumentacji systemu informatycznego rachunkowości, o poprawności gromadzenia i wprowadzania danych w systemie informatycznym rachunkowości, o poprawności przetwarzania danych oraz poprawności tworzenia sprawozdań i raportów finansowych, o przechowywania dokumentów księgowych i ksiąg rachunkowych, o wiarygodności i funkcjonalności dla wybranych podsystemów rachunkowości w jednostkach sektora finansów publicznych. Omówiono procedury kontroli dla podsystemów rachunkowości, które są najczęściej stosowane w praktyce tych jednostek, m.in.
dotyczące ewidencji środków trwałych, ewidencji płac i pozostałych rozrachunków z pracownikami oraz funkcji obsługi rozliczeń bankowych i kasy.